Более 30 новых для науки видов бактерий были обнаружены в образцах пациентов университетской больницы Базеля, Швейцария. Некоторые из них имеют клиническое значение и поэтому могут открыть новые возможности исследований для тех, кто хочет лучше понять или найти методы лечения связанных с ними инфекций. Исследование опубликовано в журнале BMC Microbiology.
Результаты также подчеркивают, сколько патогенов все еще существует и еще не определено – и с этим необходимо разобраться, если мы хотим справиться с множеством бактериальных инфекций, от которых страдает наш вид. Знание причин этих состояний значительно облегчает их лечение, поэтому исследования, подобные этому, так важны.
«Такие прямые связи между недавно выявленными видами бактерий и их клинической значимостью редко публиковались в прошлом», — пояснил в своем заявлении ведущий автор исследования доктор Дэниел Гольденбергер .
Гольденбергер и соавторы собирают и анализируют образцы пациентов с 2014 года, изучая в общей сложности 61 неизвестный бактериальный патоген у людей с различными заболеваниями. Однако секвенирование этих бактериальных геномов оказалось непростой задачей: традиционные методы не дали результатов, поэтому команде пришлось обратиться к относительно новому методу их анализа.
Затем они использовали алгоритм для сравнения последовательностей с известными штаммами, идентифицировав 35 новых видов. Из них 27 были выделены из образцов глубоких тканей или культур крови – и, что особенно важно, семь были клинически значимыми, а это означает, что они могут вызывать инфекции у людей. Остальные 26 бактерий были отнесены к категории «трудно идентифицируемых».
Большинство вновь выявленных видов принадлежало к двум родам: Corynebacterium (шесть видов) и Schaalia (пять видов).
«Многие виды этих двух родов встречаются в естественном микробиоме кожи и слизистой оболочки человека. Вот почему их часто недооценивают, а исследования по ним проводятся редко», — добавил Гольденбергер. Однако они могут представлять угрозу для нашего здоровья, если попадут в кровоток.
Интерес команд вызвал не только недавно обнаруженный вид. Одна из «трудно идентифицируемых» бактерий, обнаруженная в ране от укуса собаки на большом пальце пациента, является, как предполагают исследователи, «новым и новым патогеном». Впервые он был выделен из ран, вызванных укусами собак или кошек, канадской группой в 2022 году.
Несмотря на успехи, работа команд продолжается: они продолжают собирать и секвенировать неизвестные патогены у пациентов университетской больницы Базеля. Фактически, к их списку уже добавлено более 20 дополнительных новых видов, что, как мы надеемся, поможет улучшить будущую диагностику и лечение инфекций.
«Общедоступные клинические и геномные данные могут помочь лучше понять клиническую и экологическую роль бактериальных организмов», — пишут авторы исследования в своем заключении. «Наша идентификация 35 новых штаммов, семь из которых кажутся клинически значимыми, показывает широкий спектр неописанных патогенов, которые еще предстоит определить».